Sven Erik Aurelius, född den 12 maj 1874 i Åsbo socken, Östergötland, död den 5 september 1935, var en svensk teolog och biskop.
Aurelius föddes i Åsbo där fadern Nils Bernhard Aurelius var kyrkoherde. Fadern avled 1881 och modern Sigrid Elisabet Matilda Petersson och de fyra barnen flyttade till Linköping 1884. Aurelius gick i skola i Linköping och flyttade sedan till Uppsala 1892 där han fortsatte sina studier vid Uppsala universitet. Han blev docent där i exegetik (Gamla testamentet) 1907 och prästvigdes i Linköpings domkyrka samma år. Han studerade vid Institut für Altertumswissenschaft des heiligen Landes i Jerusalem 1910 och blev 1912 professor i exegetisk teologi (Nya testamentet) vid Lunds universitet samt kyrkoherde i Hällestad, Dalby och Bonderup. Han utnämndes till biskop i Linköpings stift 1927.
Aurelius gifte sig 20 juni 1912 med Julia Marx, som för övrigt introducerade adventsstjärnan i Sverige. Han var tvillingbror till Bengt Olof Aurelius. Erik Aurelius är farfar till förre biskopen i Göteborgs stift, Carl-Axel Aurelius och förre biskopen i Skara stift, Erik Aurelius den yngre.